銳賽生物

靶標發現與功能驗證基因操作和基因組編輯藥物靶標開發生化/細胞水平驗證高通量高內涵分析GPCR/核受體檢測激酶檢測體外藥理學體外安全性評價藥代動力學毒理學評價藥代動力學/毒理學抗腫瘤藥理評價代謝類和心腦血管疾病藥理評價中樞神經系統藥理評價炎癥/自身免疫疾病藥理評價體內藥理學立項成果展示腫瘤個性化治療項目QPCRWB檢測ELISA檢測甲基化檢測SNP檢測高效液相色譜法(HPLC)蛋白質譜基因芯片核酸、蛋白分析服務目的基因的ORF克隆化學合成質粒載體構建siRNA的細胞轉染及篩選技術服務shRNA載體構建及篩選技術服務RNAi病毒包裝及篩選技術服務miRNA的表達載體構建及病毒包裝載體構建及篩選服務chipchip-seqIPCO-IPRNA免疫共沉淀(RIP)RNA pull down免疫共沉淀實驗服務慢病毒包裝腺病毒包裝細胞培養原代細胞分離干細胞誘導分化CCK-8檢測流式周期檢測流式凋亡檢測流式分選細胞流式鑒定細胞表面抗體活性氧(ROS)檢測線粒體膜電位檢測transwell檢測管腔形成實驗細胞黏附實驗細胞克隆形成實驗細胞免疫熒光檢測穩轉株構建雙熒光素酶檢測細胞干性成球能力磁珠分選細胞MDA(丙二醛)檢測酶活動力學檢測HDA檢測細胞實驗服務常規化學染色免疫組化(IHC)免疫熒光(IF)原位雜交(ISH)熒光原位雜交(FISH)原位末端標記染色(TUNEL)組織樣本處理拍照處理病理學檢測服務裸鼠皮下成瘤(CDX模型)人源腫瘤移植模型(PDX模型)糖尿病/肥胖模型心血管類疾病模型腎臟疾病模型肝臟疾病模型炎癥與自身免疫疾病模型呼吸系統疾病模型其他疾病模型動物實驗服務2019精品SCI2018精品SCI2017精品SCI往年精品SCI案例庫漂亮SCI案例庫科研轉化成果u.cad癌癥篩查檢測全外顯子組基因檢測其他疾病基因檢測生物信息數據分析服務腫瘤學領域研究平臺病理學中心實驗室心血管與代謝領域疾病研究平臺炎癥與自身免疫疾病領域研究平臺特發肺纖維化疾病領域研究平臺抗體藥物一體化臨床前研發平臺藥性評價平臺公司新聞價值金字塔三元悖論為客戶贏得榮譽誠覓英才內部推薦加入我們留言板聯系我們推薦朋友SCI論文發表獎勵制度科研資助POLOdeliverer3000CCK-8Annexin V-FITCAnnexin V-RFPECL 發光液細胞周期與凋亡檢測自研試劑基因質粒病毒免費送細胞庫動物飼料促銷活動

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基因芯片

gene chip



實驗原理


基因芯片 (gene chip)是目前生物芯片家族中最完善、應用最廣泛的芯片,將許多特定的寡聚核苷酸或DNA片段(稱為探針)固定在芯片的每個預先設置的區域內,將待測樣本標記后同芯片進行雜交,利用堿基互補配對原理進行雜交,通過檢測雜交信號并進行計算機分析,從而檢測對應片段是否存在、存在量的多少,以用于基因的功能研究和基因組研究、疾病的臨床診斷和檢測等眾多方面。運用縮微技術,基因芯片能夠同時分析成千上萬個生物樣本,將許多不連續的分析過程集成于玻璃介質上,使這些分析過程連續化、微型化、集成化和自動化。其中最成功的典型基因芯片是在介質表面有序地點陣排列DNA,因此又叫DNA微陣列(DNA microarray)。

基因芯片的基本原理是利用雜交的原理,即DNA根據堿基配對原則,在常溫下和中性條件下形成雙鏈DNA分子,但在高溫、堿性或有機溶劑等條件下,雙螺旋之間的氫鍵斷裂,雙螺旋解開,形成單鏈分子(稱為DNA變性,DNA變性時的溫度稱Tm值)。變性的DNA黏度下降,沉降速度增加,浮力上升,紫外吸收增加。當消除變性條件后,變性DNA兩條互補鏈可以重新結合,恢復原來的雙螺旋結構,這一過程稱為復性。復性后的DNA,其理化性質能得到恢復。利用DNA這一重要理化特性,將兩個以上不同來源的多核苷酸鏈之間由于互補性而使它們在復性過程中形成異源雜合分子的過程稱為雜交(hydridization)。雜交體中的分子不是來自同一個二聚體分子。由于溫度比其他變性方法更容易控制,當雙鏈的核酸在高于其變性溫度(Tm值)時,解螺旋成單鏈分子;當溫度降到低于Tm值時,單鏈分子根據堿基的配對原則再度復性成雙鏈分子。因此通常利用溫度的變化使DNA在變性和復性的過程中進行核酸雜交。

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圖一實驗原理展示圖


基因芯片包括:


1、lnRNA芯片 


lncRNA芯片特點

  1. 唯一全轉錄本技術設計的LncRNA芯片,歐易生物與affymetrix共同設計完成;唯一一款針對lncRNA全轉錄本設計的芯片,affymetrix全球首款和企業合作的lncRNA芯片產品

  2. 27,134條coding基因和63,542條non-coding,基因信息最新最全;27,134條coding基因和63,542條non-coding,affymetrix所有商業產品,lncRNA信息最全的一款芯片。

  3. Affymetrix認證服務商;

  4. 提供特色lncRNA高級分析內容。


lncRNA芯片應用:篩選差異表達的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注釋、lncRNA調控機制預測。

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lncRNA芯片技術流程


2、mRNA芯片


實驗原理

mRNA 表達譜基因芯片是用于基因功能研究的一種基因芯片。是目前技術比較成熟,應用最廣泛的一種基因芯片。

用不同的熒光染料通過逆轉錄反應將不同組織或細胞的mRNA分別標記成不同的探針,將探針混合后與芯片上的基因進行雜交、洗滌,用特有的熒光波長掃描芯片,得到這些基因在不同組織或細胞中的表達譜圖片,再通過計算機分析出這些基因在不同組織中表達差異的重要信息。是基因功能研究的一種重要手段。


技術應用

對來源于不同個體(正常人與患者)、不同組織、不同細胞周期、不同發育階段、不同分化階段、不同病變、不同刺激(包括不同誘導、不同治療階段)下的細胞內的mRNA或逆轉錄后產生的cDNA與表達譜基因芯片進行雜交,可以對這些基因表達的個體特異性、組織特異性、發育階段特異性、分化階段特異性、病變特異性、刺激特異性進行綜合的分析和判斷,迅速將某個或幾個基因與疾病聯系起來,極大地加快這些基因功能的確立,同時進一步研究基因與基因間相互作用的關系。無論何種研究領域,利用表達譜基因芯片可以獲得大量與研究領域相關的基因,使研究更具目的性和系統性,同時也拓寬研究領域。

我公司主要采用美國Affymetrix 公司基因芯片技術平臺。Affymetrix 公司是基因芯片產業先行者,其開發的寡核苷酸原位光刻合成專利技術(light-controlled in situ synthesis of DNA microarrays),是目前最高密度的芯片制備技術。Affymetrix 公司以其完備的芯片設計,穩定可靠的分析結果和強大的生物信息學分析能力,幫助研究人員在短時間內獲得大量可靠的結果,為后續研究提供重要的線索和幫助。

 

實驗流程

客戶提供實驗組及對照組樣本——RNA抽提和純化——RNA樣品質控——total RNA中的mRNA進行放大、標記和純化——芯片雜交——結果掃描——結果分析


3、miRNA芯片


miRNA芯片應用:檢測miRNA表達水平、差異miRNA篩選、差異miRNA靶基因預測

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miRNA芯片分析流程


數據分析(以miRNA芯片分析為例)


標準分析

芯片預處理與標準化;

篩選差異表達microRNA;

microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等;

microRNA靶基因預測,基于多數據庫整合的靶基因預測以及上海豐核自主知識產權的預測軟件同時識別;

對預測的microRNA的靶基因進行GO富集分析通路富集分析等。

個性化分析

1.microRNA網絡分析:microRNA靶基因失調網絡;microNRA功能協同作用網絡。

2.microRNA與其他芯片整合分析:與lncRNAs芯片結果聯合分析(ceRNA Analysis);與mRNA芯片整合分析;與DNA甲基化芯片結果聯合分析。

3.與臨床數據整合分析

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